- r -

• R0toR() : MDFrame
• randomposition() : MDFrame
• Read() : LFile
• read() : AUXFile
• read_files() : MEAMFrame
• readblock() : POSCARFile , LAMMPSFile , AVGCNFile , MDCASKconFile , CNFile , MDCASKinputFile , AUXFile , CNFile
• readcn() : MDFrame , Converter , IsingFrame
• readeam() : EAMFrame
• readfile() : FSParam
• readHessian() : MDFrame
• readLAMMPS() : MDFrame
• readMDCASK() : MDFrame
• readMDCASKJAIME() : MDFrame
• readMEAM() : EAMFrame , MEAMFrame
• readnextstring() : SCParser
• readoutcarstress() : VaspBox
• readpath() : IsingFrame
• readPOSCAR() : MDFrame
• readpot() : FSFrame
• readRASMOLXYZ() : MDFrame
• readRchain() : MDFrame
• readXYZ() : MDFrame
• redefinepbc() : MDFrame
• reflashS() : Converter
• Refresh() : SYWindow
• relabelatom() : MDFrame
• relax() : MDFrame
• relax_by_group() : MDFrame
• removeellipsoid() : MDFrame
• removefixedatoms() : MDFrame
• removeoverlapatoms() : MDFrame
• removerectbox() : MDFrame
• removetorquehandle() : MDFrame
• Rename() : LFile
• reopen() : AUXFile
• reorient() : Matrix33
• replacefreeatom() : MDFrame
• restoreH() : MDFrame
• reversefixedatoms() : MDFrame
• reversepath() : IsingFrame
• reversergb() : SYWindow
• reversespecies() : MDFrame
• rhoeam() : EAMFrame
• rhof() : MEAMFrame
• rhoMEAM() : EAMFrame , MEAMFrame
• RHtoS() : MDFrame
• rods_potential() : RODSFrame
• RODSFrame() : RODSFrame
• rotate() : MDFrame , IsingFrame , XGeo
• rotate_com() : MDFrame
• rotateTo() : YWindow
• Routine() : SYWindow
• rscrn() : MEAMFrame
• RtoR0() : MDFrame
• run() : MDFrame
• Run() : SYWindow
• runcommand() : MDFrame , IsingFrame
• runMC() : MDFrame
• runMCSWITCH() : MDFrame
• runMDSWITCH() : MDFrame
• runTAMC() : MDFrame