- a -

• abortparser() : SCParser
• add() : Vector3
• addbend() : MDFrame
• addFext_to_group() : MDFrame
• addnv() : Vector3
• addnvv() : Matrix33
• addtorque() : MDFrame
• adj() : Matrix33
• al_glue() : ALGLUEFrame
• ALGLUEFrame() : ALGLUEFrame
• Alloc() : Path , IsingFrame , LJBONDFrame , MDFrame , MEAMFrame , ALGLUEFrame , MEAMFrame , RODSFrame , BMBFrame , EAMFrame , FSFrame
• Alloc_Bonds() : RODSFrame
• AllocChain() : MDFrame
• alloccolors() : IsingFrame , MDFrame , XGeo
• alloccolorsX() : MDFrame , IsingFrame
• allocDFS() : IsingFrame
• AllocNamedColor() : SYWindow
• allocQLM() : MDFrame
• AllocRGBColor() : SYWindow
• AllocShortRGBColor() : SYWindow
• AnalyzeConfigs() : IsingFrame
• annealpath() : MDFrame
• Append() : Path
• applyconstraint() : MDFrame
• applyRot() : YWindow
• applyRotate() : YWindow
• applystrain() : MDFrame
• assign_Lam() : MDFrame , IsingFrame
• assignvar() : FSParam , SCParser , Organizer
• atomeye() : MDFrame
• AUXFile() : AUXFile
• AVGCNFile() : AVGCNFile